Najprościej mówiąc "Chakra" jest to energia, zmieszana z dwóch podstawowych elementów człowieka, siły fizycznej, dzięki której normalny człowiek wykonuje codzienne czynności, takie jak: prace lub odbywanie nauki na w/fie, np.: pompki, przysiady, skłony i inne, jak i mentalnej (psychicznej) odpowiadającej za pamięć, czytanie i myślenie. Innymi słowy techniki ninja wykorzystują chakrę, energię ciała, istniejącą w każdej jego komórce, jak i energię duchową, którą gromadzi się poprzez trening i zdobywanie doświadczenia. Po ich zmieszaniu formujemy pieczęć, i wybieramy jeden z elementów żywiołu (Suiton - wody, Katon - ognia, Raiton - błyskawicy, Doton - ziemi i Fuuton - wiatru), co prowadzi do wykonania techniki, lecz to nie tak proste jakby się wydawało. Przy wykonywaniu technik z użyciem chakry, najważniejsze jest jej opanowanie, kontrolowanie i stabilizacja. Dodanie jej za dużo, prowadzi do nie zbyt zadowalających wyników, a kiedy damy jej za mało, wcale nie uda nam się wykonać techniki, lub wykonamy ją niekompletną. Dlatego też ważne jest, aby shinobi wiedział jakie ilości chakry z siebie wydobyć i kiedy odpowiednio ją zmieszać. Nie kontrolowana chakra może prowadzić do śmierci. Człowiek w Naruto, jest czymś w rodzaju "bateri" - kiedy energia się wyczerpie człowiek ginie. Chakra jest podstawą do wykonania Ninjutsu i Genjutsu. Ninja który wykonuje technikę doskonale doprowadził do perfekcji powiązanie umysłu i ciała. Jak każdy fan wie, świat Naruto nie jest normalnym światem, dlatego też bohaterowie w nim występujący także nie. Dokładniej chodzi mi o układ wewnętrzny, przez który przechodzi chakra. Wiadomo, że w człowieku są dwa układy niezbędne do życia, limfatyczny i krwionośny. W świecie Naruto każdy z postaci ma w sobie trzeci układ przez który przepływa chakra. Są to cieniutkie żyłki oplatające każdy organ ludzkiego ciała zakończone mikroskopijnej wielkości otworkami zwanymi "Tenketsu", to przez nie właśnie chakra wydostaje się z organizmu ludzkiego. Członkowie klanu Hyuuga potrafią wydobyć chakrę z każdego punktu na swoim ciele, ten styl nazywa się "Jyuken". Członkowie tego klanu potrafią z łatwością dostrzec te mikroskopijne otworki i zaburzyć przepływ chakry w organizmie po przez ich zablokowanie ciosem. Przeciwnik traci wtedy możliwość stosowania technik i musi polegać tylko na taijutsu. Nawiązując do Taijutsu, w Naruto rodzą się także ludzie nie mający żadnego talentu w posługiwaniu się chakrą, znamy dwóch Maito Gaia i Rocka Lee. W ich ciele płynie chakra, lecz nie umieją jej wykorzystać.
Podsumowując w świecie Naruto wszystko obraca się wokół chakry, walki, misje jak i codzienne życie, jedni prowadzą do jej opanowania i perfekcji a inni po prostu żyją, to z jej braku umierają jak i dzięki niej żyją, dobrze wykorzystana może być śmiertelną bronią, lecz niewiedza o jej istnieniu może stać się tragiczna w starciu z przeciwnikiem.

Natury chakry
Jak wiadomo chakra jest niezbędnym elementem do wykonania najprostszego Ninjutsu. Techniki te możemy podzielić pod względem umiejętności shinobi/kunoichi jak i również pod względem poszczególnego żywiołu użytego do jutsu. Znanych jest nam 5 natur chakry:
 

• Doton (element ziemi) - Shinobi wykorzystujący ten element umie kontrolować nie tylko piasek ale każdą jego "odmianę". Najbardziej popularnym użytkownikiem tego elementu jest Gaara.
   
• Fuuton (element wiatru) - Ninja kontrolujący ten żywioł z łatwością może przywołać ogromne tornada, czy też wykorzystać samą niszczycielską moc wiatru. Elementu tego używa Temari z Wioski Ukrytego Piasku.
   
• Katon (element ognia) - Shinobi posługujący się tym żywiołem może wytworzyć ogromne kule ognia. Natura ta jest z góry przyporządkowana każdemu członkowi klanu Uchiha.
   
• Raiton (element elektryczności) - Shinobi dzięki temu elementowi z łatwością kontroluje pioruny i wszystko co jest z nimi związane. Raiton jest żywiołem Raigi jednego z Siedmiu Mistrzów Miecza Ukrytej Mgły.
   
• Suiton (element wody) - Ninja władający tą naturą może wytworzyć więzienie z wody lub też samą wodę. Mistrzem tego żywiołu jest Kisame Hoshigaki, partner Uchiha Itachiego.

Wszystkie te elementy są ze sobą powiązane. Każdy element jest silniejszy od poprzedniego, ale za to słabszy od następnego. Shinobi używający elementu ognia ma przewagę nad ninja posługującym się elementem wiatru. Natomiast w starciu z przeciwnikiem używającym elementu wody, shinobi ten nie miałby prawie żadnych szans.



Wybór natury chakry
Wyboru tego nie dokonuje shinobi, natura jego chakry jest z góry narzucona jemu samemu. Tak jak w przypadku klanu Uchiha, gdzie członkom tego klanu "nadana" jest natura ognia. Narzędziem umożliwiającym odkrycie natury chakry shinobi jest specjalny papier wykonany z drzewa, które przez długi czas rosło na chakrze, reagujący nawet na najdrobniejszą ilość chakry wygenerowaną przez ninja. Samo odkrycie natury chakry polega na zbadaniu zachowania się "wskaźnika". Jeśli papier zostanie zgnieciony oznacza to że naturą tego shinobi jest Raiton, jeśli zostanie przecięty na dwie części oznacza to Fuuton. Gdy papier zamoknie oznacza to nature Saiton, gdy się spali shinobi używa natury ognia, w przypadku Doton wskaźnik zamieni się w popiół.



Oczywiście każdy shinobi może używać kilku natur, ale wymaga to od niego długiego i bardzo ciężkiego treningu przez który przechodzą tylko najsilniejsi. Używanie dwóch czy więcej natur chakry wiąże się jeszcze z tworzeniem zupełnie nowych elementów. Aby stworzyć nową naturę shinobi musi być członkiem klanu który posiada takie zdolności. W Naruto tylko dwóch shinobi posiadło tą umiejętność. Haku, który łącząc ze sobą wodę oraz wiatr otrzymał Hyouton, lód który był odporny na żywioł ognia. Drugim jest Shodai Hokage, który połączył ziemię z wodą i otrzymał Mokuton, znane jako drzewo życia.